44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4258 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  100 
 
 		 368 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  35.56 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  33.33 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  24.05 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.78 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.24 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  21.87 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.47 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  24.73 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.1 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  24.43 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  24.43 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  24.65 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  24.65 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  24.72 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  25.86 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  25.86 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  24.65 
 
 		 347 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  22.7 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  23.43 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  23.61 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  29.33 
 
 		 255 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  22.38 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  29.36 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  29.36 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  28.8 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  28.8 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  28.8 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  28.8 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  28.8 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  23.9 
 
 		 283 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  23.96 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  25.35 
 
 		 370 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 181 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  23.46 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  22.38 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  25.29 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  24.81 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  25 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  26.71 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  28.44 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  23.87 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  28.28 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>