49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3086 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  100 
 
 		 366 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  41.09 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  34.06 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.4 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  25.28 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.01 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  24.72 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  24.72 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  24.72 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  25.45 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  26.47 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  26.28 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.17 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  25.61 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  25.74 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  25.96 
 
 		 353 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  19.93 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  23.96 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.49 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  23.72 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  22.9 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  24.08 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  24.08 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  23.87 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  24.08 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  26.82 
 
 		 181 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  26.2 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  22.9 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  24.08 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  24.08 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  31.03 
 
 		 348 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  26.79 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  27.92 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  32.86 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  25.36 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  21.25 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  28.18 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  29.07 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  29.07 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  31.76 
 
 		 159 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>