22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3099 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  73.75 
 
 		 163 aa  231  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  79.23 
 
 		 163 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  75.37 
 
 		 167 aa  213  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.68 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  46.31 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  44.59 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  42.76 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  41.03 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  43.65 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  42.31 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  41.96 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  41.32 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  33.85 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  44.86 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  35.9 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.82 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  32.12 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  31.29 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  29.03 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05330  hypothetical protein  32.71 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>