18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0147 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  314  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  42.2 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  43.93 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  42.2 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  37.67 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  44.86 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  41.12 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.96 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  43.12 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  44.95 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  33.02 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  35.19 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  36.7 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  32.41 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  37.04 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  29.31 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  29.36 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>