19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1520 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  100 
 
 		 158 aa  321  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  41.77 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  42.67 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  40.51 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  38 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  37.9 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  37.21 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  37.69 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  36.22 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  33.85 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  38.06 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.46 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  35.4 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  30.97 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  34.23 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  29.31 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  32.93 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>