22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0322 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  323  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  56.38 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.45 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  40.77 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  40.77 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  37.25 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  41.13 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  39.47 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  39.26 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  40.56 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  37.7 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  38.64 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  93.6  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  38.06 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  28 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.34 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  35.19 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  30.95 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  26.67 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02079  signal peptide protein  33.33 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  29.03 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  27.19 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>