22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0562 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  100 
 
 
162 aa  336  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  43.15 
 
 
161 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.35 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  41.41 
 
 
167 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  42.31 
 
 
162 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  42.97 
 
 
163 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  42.97 
 
 
163 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  41.41 
 
 
156 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  38.64 
 
 
159 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  38.4 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  34.4 
 
 
159 aa  94  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  40.98 
 
 
161 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  34.46 
 
 
156 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  36.22 
 
 
158 aa  88.2  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  31.01 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  33.04 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  32.74 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  29.36 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  32.67 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05330  hypothetical protein  40.28 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>