24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2140 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 288 aa  590  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.16 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  31.45 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  32.32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  34.41 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  38.36 
 
 		 160 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 120 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  30.77 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  38.36 
 
 		 180 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.36 
 
 		 180 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 138 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 152 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 184 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.19 
 
 		 137 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.54 
 
 		 127 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 177 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 169 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  36.99 
 
 		 182 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>