69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2130 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2130  cupin 2, barrel  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06907  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0676  hypothetical protein  37.36 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2487  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.27 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45610  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1847  hypothetical protein  41.76 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000905  lipid A 3-O-deacylase  39.77 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1589  hypothetical protein  37.78 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106863  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4261  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4627  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1446  hypothetical protein  33.67 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.48833  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6099  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1597  cupin 2, barrel-containing protein  31.96 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00444258  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6465  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2846  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341325  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2854  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  37.5 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0389028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1304  hypothetical protein  32.58 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2347  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  36.84 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1914  cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.04 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.249211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6918  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5251  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1869  hypothetical protein  32.26 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2341  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  35.11 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.443612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3968  cupin 2, barrel  32.95 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2353  cupin 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3989  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0189718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2206  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3568  hypothetical protein  34.07 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1476  cupin family protein  33.33 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000241751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2292  hypothetical protein  35.16 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3547  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2566  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2477  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.890944  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1490  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0578  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  36.56 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4122  hypothetical protein  32.95 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0837  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.665857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0763  cupin family protein  34.07 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0980  cupin 2, barrel  32.61 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1495  cupin 2 domain-containing protein  28.44 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3793  hypothetical protein  34.44 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1004  hypothetical protein  32.63 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6036  cupin 2 domain-containing protein  26.85 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5672  cupin 2, barrel  26.85 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6526  cupin 2 domain-containing protein  26.85 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948308 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0011  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157017  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0273  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0948  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3135  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0832  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0846  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3511  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3702  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0900  hypothetical protein  32.26 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0817  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0804  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1558  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645752  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7450  hypothetical protein  26.19 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0995  hypothetical protein  31.03 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.918435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.74 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1497  hypothetical protein  26.6 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389737  normal  0.287846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4502  cupin 2 domain-containing protein  26.19 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4044  cupin 2 domain-containing protein  26.19 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.97 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>