74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0900 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  355  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0995  hypothetical protein  58.72 
 
 		 173 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.918435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3989  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.66 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0189718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1914  cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6465  cupin 2 domain-containing protein  42.72 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2206  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6918  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3568  hypothetical protein  41.67 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11861  hypothetical protein  50.85 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.186846  normal  0.0590621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0980  cupin 2, barrel  39.39 
 
 		 107 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1589  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1495  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 110 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2353  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4044  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4502  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2347  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  42.39 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1869  hypothetical protein  37.14 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0804  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 107 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 		 105 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3135  cupin 2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 109 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4261  cupin 2 domain-containing protein  45.56 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4627  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.56 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1490  hypothetical protein  36.54 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0832  cupin 2 domain-containing protein  36.56 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3511  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86943 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000905  lipid A 3-O-deacylase  36.54 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3793  hypothetical protein  36.56 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2341  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  40.59 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.443612  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11091  hypothetical protein  45.76 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.175391  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0392  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00640891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.249211 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5672  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6099  cupin 2 domain-containing protein  37.62 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6036  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7450  hypothetical protein  34.29 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6526  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06907  hypothetical protein  35.29 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2846  hypothetical protein  39.42 
 
 		 109 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341325  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10811  hypothetical protein  45 
 
 		 60 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.906899  normal  0.0229672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0578  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  36.89 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1476  cupin family protein  34.82 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000241751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0837  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.665857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0817  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2487  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.24 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3968  cupin 2, barrel  42.27 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2477  cupin 2 domain-containing protein  36.45 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.890944  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.57 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0389028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0846  cupin 2 domain-containing protein  40.54 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5251  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11171  hypothetical protein  38.98 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.273412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0676  hypothetical protein  35.16 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1030  hypothetical protein  38.98 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0162436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11181  hypothetical protein  38.98 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.764797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1497  hypothetical protein  34.91 
 
 		 116 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389737  normal  0.287846 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1847  hypothetical protein  33.96 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45610  hypothetical protein  37.62 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4122  hypothetical protein  39.8 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1004  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0948  cupin 2 domain-containing protein  40.54 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2854  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  33.33 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0067  cupin 2 domain-containing protein  37.36 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0540869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1446  hypothetical protein  34.44 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.48833  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2566  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3547  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2292  hypothetical protein  30.39 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0763  cupin family protein  29.41 
 
 		 105 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1304  hypothetical protein  34.44 
 
 		 118 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1558  hypothetical protein  33.98 
 
 		 116 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 116 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1597  cupin 2, barrel-containing protein  36.84 
 
 		 115 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00444258  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0739  cupin 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 52 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2130  cupin 2, barrel  32.26 
 
 		 106 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>