22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10448 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10448  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  28 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 
210 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.12 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  25.23 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  35.62 
 
 
120 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  34.25 
 
 
120 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  34.25 
 
 
120 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  34.25 
 
 
120 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  34.25 
 
 
120 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 
120 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  34.25 
 
 
120 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  34.25 
 
 
120 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  34.25 
 
 
120 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  34.25 
 
 
120 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  38.67 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.14 
 
 
112 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  31.88 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  38.33 
 
 
112 aa  41.6  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  24.66 
 
 
188 aa  41.2  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 
122 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>