53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1973 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  69.74 
 
 
98 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  65.28 
 
 
77 aa  100  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.52 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1550  hypothetical protein  52.78 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  56.86 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  56.52 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  46.3 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  40.62 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  48.94 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  43.1 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  52.17 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  52.17 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  48.98 
 
 
354 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  44.68 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  44.68 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  44.68 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  44.68 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  44.68 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  44.68 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03037  hypothetical protein  49.02 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374942  normal  0.0219122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  48.98 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  45.83 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  36.99 
 
 
199 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  43.1 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  44.68 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  45.1 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  45.65 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  39.19 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  37.5 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  44.44 
 
 
240 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  44.44 
 
 
240 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  43.48 
 
 
86 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.22 
 
 
240 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  42.55 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  46.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  46.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  47.62 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  48.72 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  38.3 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  38.3 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  41.3 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2292  hypothetical protein  48.08 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0146361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2348  hypothetical protein  38.78 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4723  hypothetical protein  38.24 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3486  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40 
 
 
254 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  38.3 
 
 
312 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.17 
 
 
318 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>