69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6283 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  220  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  49.45 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  44.71 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  48.81 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  54.93 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  45.88 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  45.88 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  48.68 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  48.28 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  48.28 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  61.29 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  56.52 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  50.59 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  51.43 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  50.59 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  48.75 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  47.44 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  47.95 
 
 		 318 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  43.37 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  42.53 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  40.58 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  45.57 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  47.14 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03037  hypothetical protein  44.3 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374942  normal  0.0219122 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  36.14 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  41.86 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  44.59 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  46.15 
 
 		 240 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  46.15 
 
 		 240 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  47.83 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0153  hypothetical protein  43.66 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2348  hypothetical protein  43.21 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1236  hypothetical protein  43.42 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000489654  unclonable  0.0000000165083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3980  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  45.07 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3486  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.28 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  39.53 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23290  hypothetical protein  39.44 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  38.57 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1765  Protein of unknown function DUF2249  43.66 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.552267  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2292  hypothetical protein  39.19 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0146361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  34.29 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1637  hypothetical protein  38.96 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.613783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4723  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  37.97 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  43.48 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2518  hypothetical protein  37.68 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0104  hypothetical protein  33.82 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1607  hypothetical protein  33.82 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1524  hypothetical protein  33.82 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0493  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 255 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.253924  normal  0.340868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2175  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  hitchhiker  0.00000399577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2384  hypothetical protein  33.8 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1329  hypothetical protein  38.33 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.266381  normal  0.659886 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1550  hypothetical protein  27.4 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1269  hypothetical protein  36.67 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4145  hypothetical protein  34.29 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.441445  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4291  hypothetical protein  21.59 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2509  hypothetical protein  33.82 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.646613  normal  0.568324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>