69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4127 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  72.94 
 
 		 95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  63.16 
 
 		 95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03037  hypothetical protein  78.48 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374942  normal  0.0219122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  54.32 
 
 		 96 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  59.77 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  63.77 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  46.67 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  55.13 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  56.41 
 
 		 77 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  51.06 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  49 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  49 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  56.41 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  52.7 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  50.63 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2348  hypothetical protein  51.28 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  43.75 
 
 		 174 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  50.72 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  45.45 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  44.44 
 
 		 204 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  47.3 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  43.37 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  49.3 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  45.65 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  45.65 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  47.89 
 
 		 240 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  45.88 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  47.89 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  44.74 
 
 		 354 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  40.24 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  41.46 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.54 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  39.02 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1236  hypothetical protein  40.48 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000489654  unclonable  0.0000000165083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0493  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  46.55 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.253924  normal  0.340868 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  44.44 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3486  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3980  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  52.17 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  48.94 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2292  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0146361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0153  hypothetical protein  32.86 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  36.23 
 
 		 312 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23290  hypothetical protein  35.14 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2384  hypothetical protein  38.57 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2518  hypothetical protein  38.24 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.82 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1637  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.613783  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1765  Protein of unknown function DUF2249  37.68 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.552267  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4723  hypothetical protein  39.34 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1329  hypothetical protein  37.31 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.266381  normal  0.659886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2175  hypothetical protein  34.78 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  hitchhiker  0.00000399577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1607  hypothetical protein  37.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0104  hypothetical protein  37.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1524  hypothetical protein  37.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4145  hypothetical protein  35.38 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.441445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2509  hypothetical protein  34.72 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.646613  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1269  hypothetical protein  37.7 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1550  hypothetical protein  36.73 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4291  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>