36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4291 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4291  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  31.17 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  30.49 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  32.86 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  29.33 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  29.33 
 
 		 79 aa  50.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  31.43 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  32.86 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  32.86 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  34.29 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  34.18 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  30.99 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  30.26 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  32.86 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1236  hypothetical protein  28.57 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000489654  unclonable  0.0000000165083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  30.14 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  26.76 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  31.58 
 
 		 354 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  27.16 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  26.76 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  28.12 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  31.08 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2348  hypothetical protein  31.71 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  29.58 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  21.59 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  27.87 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3980  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 279 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166749  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1765  Protein of unknown function DUF2249  31.58 
 
 		 104 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.552267  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>