69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2295 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  166  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  61.33 
 
 
79 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  66.2 
 
 
96 aa  100  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  59.21 
 
 
78 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  56.96 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  60.26 
 
 
89 aa  97.1  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  53.95 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  54.17 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  56.76 
 
 
318 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  53.95 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  53.95 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  56.76 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  55.13 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  55.13 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  55.56 
 
 
96 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  51.9 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  63.49 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  54.05 
 
 
240 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  64.52 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  52.7 
 
 
240 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  52.7 
 
 
240 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  48.68 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  48.05 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  51.95 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  51.95 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  51.95 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  51.95 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  51.95 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  51.95 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  54.17 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  55.56 
 
 
204 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  55 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  55 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  51.95 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  50.65 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  56.94 
 
 
174 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_003296  RS03037  hypothetical protein  52.86 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374942  normal  0.0219122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  48.15 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  51.32 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  51.35 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  52.11 
 
 
354 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3980  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50.72 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1236  hypothetical protein  46.05 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000489654  unclonable  0.0000000165083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2348  hypothetical protein  45.45 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3486  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.66 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2292  hypothetical protein  45.24 
 
 
86 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0146361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  43.84 
 
 
312 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1765  Protein of unknown function DUF2249  50 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.552267  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23290  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0153  hypothetical protein  43.48 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0493  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
255 aa  63.5  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.253924  normal  0.340868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1637  hypothetical protein  41.1 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.613783  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4291  hypothetical protein  31.17 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2384  hypothetical protein  37.14 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1329  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.266381  normal  0.659886 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
180 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  43.08 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4145  hypothetical protein  37.93 
 
 
86 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.441445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2175  hypothetical protein  42.37 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  hitchhiker  0.00000399577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2509  hypothetical protein  39.68 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.646613  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  46.81 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  37.5 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0104  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1524  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1607  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2518  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1269  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1550  hypothetical protein  46.51 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4723  hypothetical protein  34.43 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>