54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2175 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2175  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  hitchhiker  0.00000399577 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1269  hypothetical protein  74.68 
 
 		 85 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1607  hypothetical protein  74.36 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0104  hypothetical protein  74.36 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1524  hypothetical protein  74.36 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4145  hypothetical protein  68.75 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.441445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1329  hypothetical protein  71.23 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.266381  normal  0.659886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2384  hypothetical protein  73.97 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2518  hypothetical protein  69.33 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4723  hypothetical protein  68.49 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2509  hypothetical protein  68.83 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.646613  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  45.95 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  45.95 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  42.65 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  42.65 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  42.65 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  42.65 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  42.65 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  42.65 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  42.65 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3486  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23290  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3980  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0153  hypothetical protein  41.67 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  39.44 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  45.16 
 
 		 240 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.55 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  40 
 
 		 354 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  42.37 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1637  hypothetical protein  36.92 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.613783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  41.67 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  39.34 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  40.68 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  39.34 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  31.88 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  43.33 
 
 		 83 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  40.98 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.46 
 
 		 318 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1765  Protein of unknown function DUF2249  41.67 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.552267  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  35.29 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  35.59 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  33.82 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  39.66 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  42.31 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  33.9 
 
 		 75 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  30.43 
 
 		 174 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_003296  RS03037  hypothetical protein  46.15 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374942  normal  0.0219122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  34.85 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  33.87 
 
 		 98 aa  41.2  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>