53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1550 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  65.79 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.51 
 
 		 180 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  52.78 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  53.52 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  39.73 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  41.67 
 
 		 354 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  41.27 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  49.12 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  39.39 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  52.17 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  38.46 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  51.06 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  33.8 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  44 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  37.93 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  38.46 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.82 
 
 		 318 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  38.98 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  38.98 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  51.22 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  46.51 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  53.85 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  32.73 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  51.22 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  38.78 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  36.21 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  27.4 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2464  protein of unknown function DUF59  30.88 
 
 		 416 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.874706  normal  0.519314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2292  hypothetical protein  45.65 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0146361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1765  Protein of unknown function DUF2249  39.22 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.552267  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  35.71 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  47.5 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  36.73 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  36.73 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1236  hypothetical protein  39.13 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000489654  unclonable  0.0000000165083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1637  hypothetical protein  35.29 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.613783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4723  hypothetical protein  37.21 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  38.1 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4145  hypothetical protein  34.78 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.441445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.1 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>