10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4743 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4743  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  228  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0361  cupin 2, barrel  58.72 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5851  hypothetical protein  55.05 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1908  cupin 2, barrel-containing protein  55.05 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0126  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.67 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2323  cupin 2, barrel  47.71 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000090808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1778  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0617369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5057  cupin 2 domain-containing protein  47.27 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.031805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11732  hypothetical protein  40.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0442429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>