11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2323 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2323  cupin 2, barrel  100 
 
 		 114 aa  239  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000090808  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5057  cupin 2 domain-containing protein  50.89 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.031805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0361  cupin 2, barrel  45.54 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4743  cupin 2 domain-containing protein  47.71 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0126  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.25 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1778  cupin 2 domain-containing protein  40.74 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0617369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1908  cupin 2, barrel-containing protein  42.86 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5851  hypothetical protein  41.96 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11732  hypothetical protein  44.83 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0442429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 85 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>