12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2770 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2770  auxin-binding protein-like protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8264  hypothetical protein  31.61 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  31.48 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  30.32 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  23.86 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  28.99 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  27.19 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  42  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  28.18 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>