51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2453 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.53 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  33.59 
 
 		 812 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  32.8 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  36.04 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  35.16 
 
 		 164 aa  62  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  33.04 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  32.56 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  32.35 
 
 		 745 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  35.9 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  35.11 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  31.25 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  30.23 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  31.13 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  28.04 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  30.47 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  36.36 
 
 		 746 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  30.08 
 
 		 130 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  32.08 
 
 		 130 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 130 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  29.55 
 
 		 136 aa  52  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 130 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  32.58 
 
 		 130 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  27.18 
 
 		 412 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 741 aa  50.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  32.73 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  35.11 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  30.68 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  35.23 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  26.95 
 
 		 1202 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  29.41 
 
 		 183 aa  48.5  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  28.71 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  32.94 
 
 		 123 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  35.62 
 
 		 123 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  29.63 
 
 		 127 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  38.03 
 
 		 129 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1217  hypothetical protein  46.15 
 
 		 119 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  48.89 
 
 		 98 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  29.52 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  26.32 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  27.08 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  29.49 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  37.08 
 
 		 101 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 105 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 105 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 127 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  31.03 
 
 		 117 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  39.06 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>