32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1461 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  100 
 
 		 127 aa  260  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  88.19 
 
 		 127 aa  236  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  77.17 
 
 		 127 aa  206  7e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  33.07 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  30.16 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  36.96 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  26.06 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  34.44 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  35.53 
 
 		 745 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  30.68 
 
 		 745 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  35.66 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  33.02 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  28.83 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  36.25 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  29.63 
 
 		 288 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  29.91 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  27.18 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  30.53 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  31.25 
 
 		 746 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  27.59 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  29.35 
 
 		 741 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  29.35 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  27.96 
 
 		 269 aa  44.3  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  30.85 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1022  hypothetical protein  25.93 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1028  hypothetical protein  27.08 
 
 		 376 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.668068  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  29.55 
 
 		 215 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>