34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1239 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  88.19 
 
 		 127 aa  236  8e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  79.53 
 
 		 127 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  30.08 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  29.41 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  25.9 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  31.48 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  32.22 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  29.06 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  34.21 
 
 		 745 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  31.11 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  34.21 
 
 		 745 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  35.71 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  30 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  25.24 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  33.58 
 
 		 246 aa  50.1  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  26.27 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  33.78 
 
 		 746 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  26.27 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  28.41 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  31.46 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  26.47 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  30.85 
 
 		 741 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  30.11 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  28.16 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  29.55 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  32.5 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1028  hypothetical protein  28.12 
 
 		 376 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.668068  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  29.17 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  29.03 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>