42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0916 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  50.36 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  49.57 
 
 
140 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  48.21 
 
 
175 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  41 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  40.7 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  38.24 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  41 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  41.38 
 
 
412 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3479  hypothetical protein  39.78 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.647985  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  33.64 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  36.04 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  31.09 
 
 
134 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  29.81 
 
 
183 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  37.5 
 
 
745 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  39.74 
 
 
746 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  26.77 
 
 
812 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  28.18 
 
 
130 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  30.56 
 
 
127 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  32.26 
 
 
745 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  31.48 
 
 
127 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  27.18 
 
 
132 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  29.63 
 
 
127 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  37.33 
 
 
129 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  27.93 
 
 
130 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  35.56 
 
 
137 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  30.93 
 
 
130 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
503 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1028  hypothetical protein  34.04 
 
 
376 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.668068  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  27.27 
 
 
130 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  30 
 
 
130 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  30.61 
 
 
139 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  26.13 
 
 
130 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  31.25 
 
 
741 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  25.89 
 
 
190 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  24.78 
 
 
1202 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  28.28 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  34.15 
 
 
176 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  30.49 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  36.23 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2262  hypothetical protein  29.55 
 
 
157 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.358798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>