23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2464 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  283  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  70.31 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  31.43 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  30.61 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  32.73 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  35.48 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  28 
 
 		 746 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  29 
 
 		 745 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  29.36 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  32.38 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  33.65 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  29.52 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  25.25 
 
 		 745 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  32.22 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  28.85 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  31.43 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  27.27 
 
 		 127 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  28.44 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  31.43 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  28.57 
 
 		 741 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  34.44 
 
 		 412 aa  40  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>