29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0675 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  36.36 
 
 
412 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  38.3 
 
 
183 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  29.51 
 
 
140 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  40.54 
 
 
166 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  40 
 
 
136 aa  58.9  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  32.12 
 
 
153 aa  58.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  29.38 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  35.66 
 
 
127 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  42.25 
 
 
746 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  39.02 
 
 
745 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  33.58 
 
 
127 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  36.36 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  37.8 
 
 
745 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  31.65 
 
 
130 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  27.23 
 
 
316 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  31.58 
 
 
133 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  29.76 
 
 
132 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  29.51 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  32.94 
 
 
130 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  27.74 
 
 
130 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  26.77 
 
 
134 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  30.56 
 
 
741 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  27.45 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  34.57 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  30.12 
 
 
130 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  31.33 
 
 
190 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  35.37 
 
 
123 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>