39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4363 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  76.15 
 
 		 130 aa  209  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  77.52 
 
 		 190 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  73.64 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  51.54 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  53.17 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  59.23 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  51.97 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  56.45 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  53.15 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  51.56 
 
 		 134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  30.1 
 
 		 746 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  28.72 
 
 		 745 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  33.33 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  28.74 
 
 		 745 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  28.18 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  34.07 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  29.2 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  27.66 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  30 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  31.25 
 
 		 741 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  30.97 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  25.38 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  28.85 
 
 		 412 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  28.72 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  28 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  32.56 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  31.82 
 
 		 316 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  31.65 
 
 		 246 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  38.67 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  29.17 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  32.61 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  35.48 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  28.23 
 
 		 1202 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  30.49 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  27.37 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>