67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0251 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  100 
 
 
745 aa  1479    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  88.07 
 
 
746 aa  1285    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  63.6 
 
 
741 aa  949    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  89.8 
 
 
745 aa  1298    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3362  C-terminal beta- propeller domain-contain secreted protein-like protein  33.75 
 
 
697 aa  277  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0179249  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2462  hypothetical protein  28.53 
 
 
652 aa  270  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0471  copper amine oxidase-like protein  29.46 
 
 
741 aa  219  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0141512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1761  hypothetical protein  30.53 
 
 
680 aa  217  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0009  secreted protein  30.61 
 
 
636 aa  210  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00303672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  29.33 
 
 
845 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3465  secreted protein  28.38 
 
 
690 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4531  hypothetical protein  26.57 
 
 
632 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.420063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6043  Secreted protein  29.51 
 
 
635 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.557993  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1971  hypothetical protein  41.35 
 
 
644 aa  183  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0353  hypothetical protein  37.54 
 
 
635 aa  183  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1144  hypothetical protein  36.48 
 
 
662 aa  180  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1498  hypothetical protein  26.08 
 
 
682 aa  169  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5041  hypothetical protein  35.42 
 
 
625 aa  168  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1174  Secreted protein containing C-terminal beta- propeller domain distantly related to WD-40 repeats-like protein  37.89 
 
 
711 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2884  Beta propeller domain protein  35.04 
 
 
685 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83857  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1394  hypothetical protein  34.29 
 
 
677 aa  130  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46646  normal  0.639448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3067  putative lipoprotein  30.58 
 
 
698 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257296  normal  0.354742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2127  hypothetical protein  37.69 
 
 
652 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1856  hypothetical protein  23.44 
 
 
690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2091  hypothetical protein  33.52 
 
 
693 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1330  hypothetical protein  30.77 
 
 
608 aa  114  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.696713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2006  hypothetical protein  31.32 
 
 
691 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0547  beta-propeller domain-containing protein  40.34 
 
 
703 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000139284  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  35.67 
 
 
787 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43674  predicted protein  28.51 
 
 
854 aa  80.9  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  41.18 
 
 
166 aa  75.5  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  40.95 
 
 
129 aa  72  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6044  hypothetical protein  27.5 
 
 
1083 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  38.14 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  35 
 
 
269 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  44.87 
 
 
164 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  44.16 
 
 
136 aa  65.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  39.08 
 
 
183 aa  64.3  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  28.72 
 
 
130 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  35.14 
 
 
130 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  38.46 
 
 
412 aa  60.1  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2055  hypothetical protein  36.84 
 
 
175 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  32.35 
 
 
215 aa  57.4  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  34.21 
 
 
127 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  33.33 
 
 
133 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  34.18 
 
 
134 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  33.7 
 
 
130 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  30.68 
 
 
127 aa  54.7  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  32.05 
 
 
190 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  32.05 
 
 
130 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  36.71 
 
 
137 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  34.21 
 
 
127 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  34.21 
 
 
140 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  36.14 
 
 
316 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  29.91 
 
 
176 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  29.73 
 
 
132 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  37.8 
 
 
246 aa  50.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  31.08 
 
 
130 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  32.94 
 
 
117 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  32.18 
 
 
123 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  29 
 
 
139 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  35.62 
 
 
123 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3225  hypothetical protein  30.59 
 
 
151 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2589  hypothetical protein  26.47 
 
 
99 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0461534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  28.77 
 
 
130 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>