39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1079 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  100 
 
 		 130 aa  263  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  85.38 
 
 		 130 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  83.85 
 
 		 190 aa  227  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  73.64 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  61.54 
 
 		 130 aa  173  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  61.9 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  61.54 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  53.17 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  61.32 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  55.2 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  52.76 
 
 		 134 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  30.53 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  36.05 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  29.92 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  30 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  30.91 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  27.2 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  31.82 
 
 		 745 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  30.53 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  32.63 
 
 		 215 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  32.26 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  31.08 
 
 		 745 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  31.4 
 
 		 746 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  35.44 
 
 		 741 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  26.67 
 
 		 412 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  31.45 
 
 		 1202 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  30.83 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  31.52 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  26.13 
 
 		 288 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  32.53 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  33.65 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  27.17 
 
 		 316 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  28.26 
 
 		 269 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  30.12 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  33.8 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  26.53 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  30.77 
 
 		 812 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  24.35 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  23.97 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>