36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4580 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  64.62 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  63.85 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  59.23 
 
 		 130 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  57.69 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  56.92 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  61.4 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  53.97 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  50.78 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  58.1 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  48.44 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  33.61 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  28.24 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  30.36 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  33.7 
 
 		 745 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  30.53 
 
 		 746 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  32.08 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  30.83 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  32.94 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  30 
 
 		 745 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  27.93 
 
 		 288 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  31.91 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  27.88 
 
 		 412 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  28.33 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  31.91 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  26.14 
 
 		 741 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  27.45 
 
 		 246 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.63 
 
 		 1202 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  27.45 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  28.21 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  29.35 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  24.22 
 
 		 316 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1363  hypothetical protein  32.47 
 
 		 160 aa  40.8  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1423  hypothetical protein  32.47 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  32.1 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>