39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3945 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  90 
 
 		 130 aa  245  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  61.54 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  60.47 
 
 		 190 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  61.54 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  52.67 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  51.54 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  50 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  57.69 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  59.05 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  32.08 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  29.01 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  29.81 
 
 		 412 aa  57.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  25.49 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  34.38 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  30 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1239  lipoprotein  29.06 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.619168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  29.79 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  31.25 
 
 		 288 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0066  hypothetical protein  33.68 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0701675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  32.58 
 
 		 215 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  28.72 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  28.3 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  29.84 
 
 		 812 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  27.84 
 
 		 269 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1893  hypothetical protein  28.04 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.479923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  28.72 
 
 		 746 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.58 
 
 		 1202 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  28.77 
 
 		 741 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  30.14 
 
 		 745 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  28.77 
 
 		 745 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  31 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  27.45 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  28.42 
 
 		 183 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  26.8 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  27.55 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  25.77 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>