25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1242 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  247  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  95.93 
 
 
123 aa  237  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1363  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1423  hypothetical protein  36.25 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  31.25 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  27.72 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  34.62 
 
 
745 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  34.07 
 
 
412 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  42.47 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  29 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  32.94 
 
 
215 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  32.18 
 
 
745 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  29.13 
 
 
127 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  31.03 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  26.67 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  30.48 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  35.62 
 
 
746 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  29.51 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  35.48 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  34.72 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0675  hypothetical protein  35.37 
 
 
246 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.994925  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  26.8 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  29.33 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  28.3 
 
 
190 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>