33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1927 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  35.11 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  24.51 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  25.49 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  30.36 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  34.62 
 
 
215 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  25.76 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  26.72 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  26.72 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  25.38 
 
 
130 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  25.95 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  29.13 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  34.57 
 
 
746 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  34.67 
 
 
316 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  36 
 
 
745 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  26.47 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1515  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  48.5  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  29 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  24.81 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  29 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  31.19 
 
 
745 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  30.59 
 
 
741 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  25.52 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  30.21 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  35.16 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1461  putative lipoprotein  32 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.093492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  28.97 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  30 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  29.73 
 
 
1022 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  24.07 
 
 
288 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  32.98 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>