50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5928 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.05 
 
 		 1045 aa  827    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  42.06 
 
 		 1025 aa  770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  48.01 
 
 		 1039 aa  885    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  48.21 
 
 		 1039 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  42.1 
 
 		 1023 aa  765    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  45.68 
 
 		 1032 aa  841    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1023 aa  787    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  45.65 
 
 		 1049 aa  820    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1031 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  42.06 
 
 		 1025 aa  773    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  42.26 
 
 		 1025 aa  775    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  46.95 
 
 		 1035 aa  876    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  45.45 
 
 		 1049 aa  819    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  41.81 
 
 		 1023 aa  775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  46.61 
 
 		 1035 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  48.23 
 
 		 1024 aa  915    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  46.31 
 
 		 1035 aa  874    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  48.27 
 
 		 1019 aa  921    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  48.78 
 
 		 1026 aa  904    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  50.95 
 
 		 1011 aa  951    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.93 
 
 		 1014 aa  767    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1025 aa  772    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  44.8 
 
 		 1029 aa  796    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  49.55 
 
 		 1001 aa  931    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  51.15 
 
 		 1011 aa  955    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  46.58 
 
 		 1014 aa  849    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  50.5 
 
 		 1035 aa  939    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1045 aa  857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  47.29 
 
 		 1045 aa  846    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  41.85 
 
 		 1008 aa  767    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  72.18 
 
 		 1066 aa  1543    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  44.34 
 
 		 1095 aa  804    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  48.11 
 
 		 1038 aa  886    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  47.19 
 
 		 1029 aa  872    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  46.62 
 
 		 1035 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  45.01 
 
 		 1034 aa  801    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  48.71 
 
 		 1030 aa  907    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  46.86 
 
 		 1014 aa  874    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  46.15 
 
 		 1049 aa  825    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  49.39 
 
 		 1026 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1010 aa  754    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  100 
 
 		 1022 aa  2096    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  46.51 
 
 		 1035 aa  877    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  42 
 
 		 1023 aa  777    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  41.9 
 
 		 1022 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  41.43 
 
 		 1015 aa  756    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  46.61 
 
 		 1035 aa  880    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  43.17 
 
 		 1041 aa  817    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  46.51 
 
 		 1035 aa  877    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  26.85 
 
 		 890 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>