53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4577 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.61 
 
 
1049 aa  803    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  42.44 
 
 
1023 aa  803    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  42.66 
 
 
1025 aa  787    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  71.78 
 
 
1039 aa  1462    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  72.08 
 
 
1039 aa  1468    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  43.31 
 
 
1023 aa  795    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  46.19 
 
 
1032 aa  830    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  45.26 
 
 
1023 aa  820    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  46.51 
 
 
1049 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  46.95 
 
 
1031 aa  861    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  42.86 
 
 
1025 aa  788    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  42.86 
 
 
1025 aa  787    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  71.98 
 
 
1035 aa  1473    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  48.95 
 
 
1035 aa  923    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.71 
 
 
1045 aa  814    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  70.81 
 
 
1035 aa  1459    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  47.76 
 
 
1024 aa  923    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  69.83 
 
 
1035 aa  1461    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  73.16 
 
 
1019 aa  1544    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  100 
 
 
1026 aa  2100    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  47.87 
 
 
1011 aa  902    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.09 
 
 
1014 aa  842    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  42.76 
 
 
1025 aa  789    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  47.64 
 
 
1029 aa  851    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  49.04 
 
 
1001 aa  914    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  47.87 
 
 
1011 aa  902    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  46.02 
 
 
1041 aa  853    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  46.61 
 
 
1049 aa  807    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  45.51 
 
 
1045 aa  825    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  45.83 
 
 
1045 aa  835    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  43.34 
 
 
1008 aa  782    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  49.66 
 
 
1066 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  45.09 
 
 
1095 aa  806    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  72.28 
 
 
1038 aa  1471    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  44.55 
 
 
1029 aa  837    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  71.01 
 
 
1035 aa  1465    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  46.81 
 
 
1034 aa  868    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  72.38 
 
 
1030 aa  1487    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  47.84 
 
 
1014 aa  891    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  48.55 
 
 
1014 aa  899    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  93.86 
 
 
1026 aa  1959    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  42.77 
 
 
1010 aa  781    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  48.07 
 
 
1022 aa  890    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  71.01 
 
 
1035 aa  1461    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  42.64 
 
 
1023 aa  805    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  42.44 
 
 
1022 aa  796    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  42.66 
 
 
1015 aa  802    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  70.13 
 
 
1035 aa  1467    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  71.01 
 
 
1035 aa  1461    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  25.32 
 
 
665 aa  50.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  27.08 
 
 
890 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  28.79 
 
 
813 aa  48.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  25.3 
 
 
778 aa  46.2  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>