58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2587 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.3 
 
 		 1049 aa  754    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  41.8 
 
 		 1023 aa  773    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1025 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  74.03 
 
 		 1039 aa  1519    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  74.52 
 
 		 1039 aa  1526    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1023 aa  745    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  44.14 
 
 		 1032 aa  792    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  42.94 
 
 		 1023 aa  781    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  43.32 
 
 		 1049 aa  763    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  43.49 
 
 		 1031 aa  805    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1025 aa  747    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1025 aa  748    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  90.14 
 
 		 1035 aa  1898    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  47.72 
 
 		 1035 aa  887    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.81 
 
 		 1045 aa  764    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  91.11 
 
 		 1035 aa  1908    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  46.59 
 
 		 1024 aa  873    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1035 aa  2107    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  65.65 
 
 		 1019 aa  1377    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  70.03 
 
 		 1026 aa  1451    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  46.36 
 
 		 1011 aa  860    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  44.84 
 
 		 1014 aa  793    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1025 aa  749    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  45.51 
 
 		 1029 aa  806    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  46.97 
 
 		 1001 aa  869    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  46.67 
 
 		 1011 aa  864    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  91.11 
 
 		 1035 aa  1909    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  43.22 
 
 		 1049 aa  763    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  42.81 
 
 		 1045 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  43.47 
 
 		 1045 aa  776    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  42.93 
 
 		 1008 aa  763    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  48.02 
 
 		 1066 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  42.58 
 
 		 1095 aa  757    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  74.32 
 
 		 1038 aa  1520    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  44.03 
 
 		 1029 aa  810    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  91.21 
 
 		 1035 aa  1909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 		 1034 aa  813    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  74.27 
 
 		 1030 aa  1524    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  45.42 
 
 		 1014 aa  838    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  70.38 
 
 		 1026 aa  1446    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  41.34 
 
 		 1010 aa  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  46.31 
 
 		 1022 aa  862    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 		 1014 aa  855    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  91.11 
 
 		 1035 aa  1909    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  41.7 
 
 		 1023 aa  770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  41.4 
 
 		 1022 aa  762    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  43.91 
 
 		 1041 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  98.65 
 
 		 1035 aa  2076    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  40.89 
 
 		 1015 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  24.16 
 
 		 890 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  25.57 
 
 		 789 aa  49.3  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  22.22 
 
 		 665 aa  48.9  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  30.99 
 
 		 626 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  26.63 
 
 		 757 aa  48.5  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  25.95 
 
 		 813 aa  48.1  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  27.27 
 
 		 691 aa  48.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  27.39 
 
 		 814 aa  47.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  20.33 
 
 		 705 aa  44.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>