70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0778 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  42.04 
 
 
1025 aa  768    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  46.04 
 
 
1041 aa  836    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  75.51 
 
 
1035 aa  1544    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  42.37 
 
 
1023 aa  778    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  42.04 
 
 
1025 aa  769    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  99.13 
 
 
1039 aa  2081    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  100 
 
 
1039 aa  2095    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  42.24 
 
 
1023 aa  758    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  46.69 
 
 
1032 aa  828    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  45.21 
 
 
1023 aa  816    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  46.41 
 
 
1049 aa  801    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  46.44 
 
 
1031 aa  847    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  42.04 
 
 
1025 aa  766    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  74.73 
 
 
1035 aa  1538    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.36 
 
 
1014 aa  808    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  48.81 
 
 
1011 aa  887    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  72.08 
 
 
1026 aa  1478    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  42.14 
 
 
1025 aa  767    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  67.78 
 
 
1019 aa  1407    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  74.4 
 
 
1035 aa  1538    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  45.78 
 
 
1049 aa  798    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  74.52 
 
 
1035 aa  1543    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  49.19 
 
 
1024 aa  904    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.37 
 
 
1045 aa  805    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  75.61 
 
 
1035 aa  1544    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 
1034 aa  825    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  48.81 
 
 
1011 aa  886    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  46.31 
 
 
1049 aa  802    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  49.15 
 
 
1001 aa  892    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  48.28 
 
 
1035 aa  899    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  44.6 
 
 
1045 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  45.02 
 
 
1045 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  44.3 
 
 
1008 aa  779    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  50.65 
 
 
1066 aa  939    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  44.47 
 
 
1095 aa  777    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  99.71 
 
 
1038 aa  2044    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  45.91 
 
 
1029 aa  852    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  74.69 
 
 
1035 aa  1536    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  91.53 
 
 
1030 aa  1895    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  48.07 
 
 
1014 aa  892    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  48.92 
 
 
1014 aa  892    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  72.84 
 
 
1026 aa  1502    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  41.73 
 
 
1010 aa  758    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  47.8 
 
 
1022 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  48.69 
 
 
1029 aa  856    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  75.51 
 
 
1035 aa  1544    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  42.17 
 
 
1023 aa  777    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  41.87 
 
 
1022 aa  767    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  41.1 
 
 
1015 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  26.04 
 
 
665 aa  52  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  30.6 
 
 
844 aa  48.1  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  30.6 
 
 
844 aa  48.1  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  27.87 
 
 
642 aa  48.1  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  30.6 
 
 
844 aa  48.1  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  30.6 
 
 
844 aa  48.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  30.6 
 
 
841 aa  47.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  30.6 
 
 
841 aa  47.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  27.21 
 
 
890 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  30.6 
 
 
844 aa  48.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  29.85 
 
 
840 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  30.71 
 
 
840 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  30.71 
 
 
840 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  30.71 
 
 
840 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  29.85 
 
 
844 aa  46.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  30.71 
 
 
840 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  30.71 
 
 
840 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  30.49 
 
 
830 aa  46.2  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0806  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
680 aa  45.8  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  28.69 
 
 
642 aa  45.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  29.93 
 
 
626 aa  45.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>