60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0974 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  46.51 
 
 
1025 aa  881    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  46.76 
 
 
1023 aa  893    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  46.51 
 
 
1025 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  46.53 
 
 
1039 aa  812    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  49.75 
 
 
1011 aa  941    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  46.84 
 
 
1039 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  47.36 
 
 
1001 aa  852    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  47.77 
 
 
1029 aa  890    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  46.32 
 
 
1023 aa  884    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  49.02 
 
 
1032 aa  918    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  46.97 
 
 
1023 aa  895    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  47.21 
 
 
1049 aa  866    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  47.43 
 
 
1031 aa  896    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  45.91 
 
 
1035 aa  816    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  46.71 
 
 
1025 aa  883    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  46.61 
 
 
1025 aa  882    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  45 
 
 
1035 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  47.01 
 
 
1049 aa  865    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  47.22 
 
 
1045 aa  870    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  46.01 
 
 
1035 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  49.6 
 
 
1024 aa  895    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 
1035 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  46.36 
 
 
1019 aa  844    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  47.55 
 
 
1026 aa  863    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  49.55 
 
 
1011 aa  934    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  47.2 
 
 
1014 aa  866    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  48.34 
 
 
1041 aa  914    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  49.25 
 
 
1035 aa  932    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  47.33 
 
 
1045 aa  885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  48.41 
 
 
1045 aa  901    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  45.62 
 
 
1008 aa  842    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  46.08 
 
 
1066 aa  828    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  50.72 
 
 
1095 aa  925    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  46.68 
 
 
1038 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  47.21 
 
 
1049 aa  863    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  48.94 
 
 
1029 aa  919    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  45.41 
 
 
1035 aa  806    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1034 aa  2112    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  46.12 
 
 
1030 aa  829    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 
1014 aa  981    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  51.71 
 
 
1014 aa  972    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  48.11 
 
 
1026 aa  877    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  44.89 
 
 
1010 aa  852    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  45.01 
 
 
1022 aa  791    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  45.91 
 
 
1035 aa  816    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  46.96 
 
 
1023 aa  897    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  46.86 
 
 
1022 aa  897    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  44.12 
 
 
1015 aa  840    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  45.27 
 
 
1035 aa  819    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 
549 aa  49.3  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  34.27 
 
 
710 aa  48.1  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  29.06 
 
 
751 aa  47.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  36.07 
 
 
713 aa  47.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  36.07 
 
 
713 aa  47.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  36.07 
 
 
713 aa  47.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 
485 aa  47  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  28.57 
 
 
778 aa  45.8  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  25 
 
 
665 aa  45.8  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  26.88 
 
 
790 aa  45.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  32.52 
 
 
655 aa  45.1  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>