83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2992 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  49.19 
 
 		 1049 aa  906    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  45.51 
 
 		 1015 aa  865    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  45.72 
 
 		 1035 aa  855    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  49.34 
 
 		 1041 aa  923    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  46.02 
 
 		 1035 aa  851    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  45.38 
 
 		 1023 aa  884    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  44.97 
 
 		 1025 aa  875    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  44.97 
 
 		 1025 aa  875    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  48.07 
 
 		 1039 aa  894    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  48.07 
 
 		 1039 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  51.15 
 
 		 1014 aa  942    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  45.22 
 
 		 1023 aa  869    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  49.43 
 
 		 1032 aa  907    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  46.83 
 
 		 1023 aa  882    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  45.28 
 
 		 1022 aa  886    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  49.54 
 
 		 1031 aa  931    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  45.18 
 
 		 1025 aa  874    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  53.69 
 
 		 1011 aa  1020    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  47.84 
 
 		 1026 aa  893    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  46.08 
 
 		 1019 aa  892    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  45.42 
 
 		 1035 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  53.19 
 
 		 1024 aa  972    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  45.18 
 
 		 1025 aa  875    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  45.92 
 
 		 1035 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 		 1035 aa  840    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  48.88 
 
 		 1049 aa  902    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  49.59 
 
 		 1045 aa  919    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  45.48 
 
 		 1023 aa  887    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  49.09 
 
 		 1049 aa  901    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  54.32 
 
 		 1035 aa  1051    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  53.69 
 
 		 1011 aa  1021    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  49 
 
 		 1045 aa  922    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  51.6 
 
 		 1001 aa  984    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  49.8 
 
 		 1045 aa  931    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  48.37 
 
 		 1008 aa  883    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  47.47 
 
 		 1066 aa  909    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  48.61 
 
 		 1095 aa  891    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  48.22 
 
 		 1038 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  48.01 
 
 		 1029 aa  920    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  48.9 
 
 		 1029 aa  908    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  45.37 
 
 		 1035 aa  842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  51.93 
 
 		 1034 aa  987    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  48.76 
 
 		 1030 aa  919    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1014 aa  2068    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  77.69 
 
 		 1014 aa  1585    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1026 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  46.37 
 
 		 1010 aa  867    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  46.46 
 
 		 1022 aa  862    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  46.02 
 
 		 1035 aa  851    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  28.47 
 
 		 655 aa  50.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 678 aa  48.9  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  31.01 
 
 		 768 aa  48.5  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  27.5 
 
 		 790 aa  48.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  26.72 
 
 		 790 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  27.48 
 
 		 783 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  26.8 
 
 		 642 aa  47  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  25.49 
 
 		 642 aa  47.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  26.07 
 
 		 774 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  26.07 
 
 		 791 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  23.42 
 
 		 813 aa  46.2  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  24.22 
 
 		 779 aa  45.8  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  23.87 
 
 		 792 aa  45.4  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  23.87 
 
 		 792 aa  45.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  27.01 
 
 		 844 aa  45.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  27.01 
 
 		 841 aa  45.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  27.01 
 
 		 844 aa  45.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  27.01 
 
 		 841 aa  45.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  27.47 
 
 		 748 aa  45.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  27.01 
 
 		 844 aa  45.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  27.01 
 
 		 844 aa  45.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  26.28 
 
 		 840 aa  45.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  26.28 
 
 		 840 aa  45.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  27.01 
 
 		 844 aa  45.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  26.28 
 
 		 840 aa  45.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  26.28 
 
 		 840 aa  45.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  26.28 
 
 		 840 aa  45.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  29.66 
 
 		 774 aa  44.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  27.01 
 
 		 840 aa  44.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  25.64 
 
 		 774 aa  44.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  25.64 
 
 		 774 aa  44.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  27.01 
 
 		 844 aa  44.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 		 773 aa  44.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  30.43 
 
 		 773 aa  44.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>