72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4731 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  52.9 
 
 		 1025 aa  1061    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  45.65 
 
 		 1035 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  53.5 
 
 		 1023 aa  1073    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  47.13 
 
 		 1001 aa  858    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  52.61 
 
 		 1025 aa  1056    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  47 
 
 		 1039 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  46.9 
 
 		 1039 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  61.21 
 
 		 1029 aa  1225    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  53.79 
 
 		 1023 aa  1046    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  64.56 
 
 		 1032 aa  1291    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  60.22 
 
 		 1023 aa  1205    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  59.61 
 
 		 1049 aa  1200    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  100 
 
 		 1031 aa  2090    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  96.41 
 
 		 1041 aa  2021    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  52.61 
 
 		 1025 aa  1055    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  59.54 
 
 		 1014 aa  1108    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  52.8 
 
 		 1025 aa  1058    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  46.07 
 
 		 1035 aa  823    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  59.42 
 
 		 1049 aa  1197    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  47.81 
 
 		 1011 aa  909    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  46.95 
 
 		 1026 aa  860    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  61.93 
 
 		 1045 aa  1206    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  45.55 
 
 		 1035 aa  816    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  49.04 
 
 		 1024 aa  902    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  43.49 
 
 		 1035 aa  807    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  46.8 
 
 		 1019 aa  862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  47 
 
 		 1030 aa  849    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  59.61 
 
 		 1049 aa  1203    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  49.65 
 
 		 1035 aa  935    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  62 
 
 		 1045 aa  1243    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  61.7 
 
 		 1045 aa  1238    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  46.47 
 
 		 1008 aa  850    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  45.5 
 
 		 1066 aa  837    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  47.39 
 
 		 1095 aa  844    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  46.9 
 
 		 1038 aa  834    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  60.16 
 
 		 1029 aa  1235    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 		 1035 aa  812    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  47.91 
 
 		 1011 aa  915    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  47.43 
 
 		 1034 aa  896    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  50.05 
 
 		 1014 aa  923    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  50.57 
 
 		 1014 aa  915    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  47.35 
 
 		 1026 aa  857    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  52.58 
 
 		 1010 aa  1016    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  43.36 
 
 		 1022 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  45.65 
 
 		 1035 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  53.5 
 
 		 1023 aa  1069    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  53.15 
 
 		 1022 aa  1064    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  51.84 
 
 		 1015 aa  1017    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  43.79 
 
 		 1035 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  28.02 
 
 		 794 aa  51.2  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  28.02 
 
 		 779 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  29.53 
 
 		 826 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  27.05 
 
 		 754 aa  50.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  30.83 
 
 		 841 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  30.83 
 
 		 844 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  30.83 
 
 		 844 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  30.83 
 
 		 844 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  30.83 
 
 		 841 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  30.83 
 
 		 844 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  30.83 
 
 		 844 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  29.68 
 
 		 844 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  29.68 
 
 		 840 aa  49.7  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  29.03 
 
 		 840 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  29.03 
 
 		 840 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  29.03 
 
 		 840 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  29.03 
 
 		 840 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  29.03 
 
 		 840 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  27.75 
 
 		 797 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  22.35 
 
 		 766 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  21.61 
 
 		 655 aa  45.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  28.46 
 
 		 642 aa  45.1  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  28.39 
 
 		 841 aa  45.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>