61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0185 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  48.88 
 
 		 1049 aa  912    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  46.97 
 
 		 1035 aa  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  45.35 
 
 		 1023 aa  894    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  45.55 
 
 		 1025 aa  896    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  48.72 
 
 		 1039 aa  898    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  48.72 
 
 		 1039 aa  901    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  45.75 
 
 		 1023 aa  886    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  50.47 
 
 		 1032 aa  913    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  47.11 
 
 		 1023 aa  880    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  48.88 
 
 		 1049 aa  915    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  50.57 
 
 		 1031 aa  933    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  45.75 
 
 		 1025 aa  894    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  45.75 
 
 		 1025 aa  895    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  47.24 
 
 		 1035 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  55.19 
 
 		 1035 aa  1045    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  49.85 
 
 		 1045 aa  934    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  46.97 
 
 		 1035 aa  872    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  53.83 
 
 		 1024 aa  999    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  45.78 
 
 		 1035 aa  865    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 		 1019 aa  918    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  48.97 
 
 		 1026 aa  907    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  53.95 
 
 		 1011 aa  1012    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  52.33 
 
 		 1014 aa  947    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  45.55 
 
 		 1025 aa  896    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  50.91 
 
 		 1029 aa  931    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  52.77 
 
 		 1001 aa  991    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  54.05 
 
 		 1011 aa  1014    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  46.22 
 
 		 1035 aa  868    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  49.09 
 
 		 1049 aa  917    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  50.41 
 
 		 1045 aa  942    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  51.14 
 
 		 1045 aa  950    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  48.55 
 
 		 1008 aa  899    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  48.3 
 
 		 1066 aa  913    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  49.07 
 
 		 1095 aa  897    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  48.87 
 
 		 1038 aa  898    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  49.55 
 
 		 1029 aa  960    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  47.01 
 
 		 1035 aa  869    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  51.71 
 
 		 1034 aa  990    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  48.91 
 
 		 1030 aa  919    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  77.69 
 
 		 1014 aa  1582    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1014 aa  2062    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  48.97 
 
 		 1026 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  50.05 
 
 		 1041 aa  922    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  45.06 
 
 		 1015 aa  863    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  45.15 
 
 		 1022 aa  891    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  45.35 
 
 		 1023 aa  892    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  46.97 
 
 		 1035 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  46.58 
 
 		 1022 aa  857    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1010 aa  856    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  30.3 
 
 		 783 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 		 678 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  29.76 
 
 		 729 aa  46.2  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  25.34 
 
 		 766 aa  46.2  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  27.56 
 
 		 790 aa  45.8  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  25.5 
 
 		 789 aa  45.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  23.9 
 
 		 890 aa  45.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  23.72 
 
 		 792 aa  44.7  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  23.72 
 
 		 792 aa  44.7  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  23.68 
 
 		 768 aa  45.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  25.34 
 
 		 790 aa  45.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 846 aa  44.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>