More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2383 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 729 aa  1444    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  63.88 
 
 		 705 aa  806    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  51.09 
 
 		 713 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  46.86 
 
 		 746 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  45.82 
 
 		 726 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  45.83 
 
 		 742 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  46.68 
 
 		 774 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  46.32 
 
 		 747 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  46.32 
 
 		 784 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  45.58 
 
 		 747 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  45.34 
 
 		 745 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  45.57 
 
 		 745 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  45.49 
 
 		 785 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  46.1 
 
 		 758 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  45.58 
 
 		 747 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  45.58 
 
 		 747 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  45.71 
 
 		 745 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  45.58 
 
 		 747 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  45.34 
 
 		 768 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  44.76 
 
 		 844 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  47.77 
 
 		 1060 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  47.77 
 
 		 942 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  47.77 
 
 		 951 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  47.77 
 
 		 923 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  47.77 
 
 		 913 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  32.88 
 
 		 719 aa  312  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  33.54 
 
 		 762 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  34.16 
 
 		 798 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  33.94 
 
 		 952 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 759 aa  273  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  36.3 
 
 		 860 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  28.92 
 
 		 857 aa  263  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.48 
 
 		 779 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  36.2 
 
 		 782 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  34.45 
 
 		 782 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  35.71 
 
 		 853 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  33.81 
 
 		 801 aa  252  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  28.79 
 
 		 770 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  33.13 
 
 		 855 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  30.67 
 
 		 980 aa  227  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  31.67 
 
 		 745 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  30.88 
 
 		 706 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  31.93 
 
 		 780 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  32.6 
 
 		 731 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 908 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  31.7 
 
 		 766 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  32.32 
 
 		 861 aa  221  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  33.09 
 
 		 706 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 		 927 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  33.8 
 
 		 696 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  32.97 
 
 		 680 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  27.76 
 
 		 774 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  29.58 
 
 		 816 aa  214  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0258  penicillin-binding protein 1C  31.47 
 
 		 699 aa  214  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  31.75 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  30.6 
 
 		 734 aa  213  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  31.2 
 
 		 787 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  31.2 
 
 		 787 aa  211  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  31.2 
 
 		 787 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  31.25 
 
 		 760 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  31.25 
 
 		 762 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  31.08 
 
 		 760 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  31.16 
 
 		 696 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  31.03 
 
 		 750 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  31.22 
 
 		 679 aa  207  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  34.1 
 
 		 771 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  32.37 
 
 		 770 aa  204  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  34.1 
 
 		 771 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  32.37 
 
 		 770 aa  204  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  34.01 
 
 		 793 aa  204  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  32.37 
 
 		 770 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  34.1 
 
 		 771 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  32.37 
 
 		 770 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  32.58 
 
 		 770 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  34.1 
 
 		 771 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  33.91 
 
 		 771 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  32.03 
 
 		 770 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  34.42 
 
 		 774 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 774 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  29.89 
 
 		 667 aa  201  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  27.2 
 
 		 722 aa  201  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  32.19 
 
 		 770 aa  200  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  32.01 
 
 		 770 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  31.1 
 
 		 774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  32.19 
 
 		 770 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  33.83 
 
 		 780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  30.91 
 
 		 662 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.15 
 
 		 618 aa  197  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  30.87 
 
 		 794 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 704 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  33.15 
 
 		 807 aa  195  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 1037 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  30.1 
 
 		 691 aa  194  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3446  penicillin-binding protein 1C  28.73 
 
 		 695 aa  194  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  31.85 
 
 		 782 aa  193  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  26.9 
 
 		 775 aa  193  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  26.73 
 
 		 772 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0509  penicillin-binding protein 1C  32.28 
 
 		 804 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  34.73 
 
 		 794 aa  191  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  32.73 
 
 		 695 aa  190  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>