More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1163 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 705 aa  1372    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  63.72 
 
 		 729 aa  809    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  52.5 
 
 		 713 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  49.37 
 
 		 746 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  48.85 
 
 		 726 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  48.21 
 
 		 758 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  47.98 
 
 		 747 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  47.61 
 
 		 774 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  47.52 
 
 		 745 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  48.09 
 
 		 745 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  47.89 
 
 		 745 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  47.29 
 
 		 768 aa  529  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  48.11 
 
 		 747 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  48.45 
 
 		 747 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  48.11 
 
 		 747 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  48.11 
 
 		 747 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  46.08 
 
 		 742 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  47.76 
 
 		 784 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  46.59 
 
 		 785 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  46.01 
 
 		 844 aa  515  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  50.11 
 
 		 1060 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  50.11 
 
 		 951 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  50.11 
 
 		 923 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  50.11 
 
 		 913 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  50.11 
 
 		 942 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  40.18 
 
 		 798 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  32.84 
 
 		 719 aa  322  1.9999999999999998e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  33.38 
 
 		 762 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  38.8 
 
 		 853 aa  308  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 		 759 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 860 aa  289  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  30.87 
 
 		 857 aa  283  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  34.65 
 
 		 801 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  35.36 
 
 		 952 aa  267  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  31.55 
 
 		 770 aa  263  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  39.82 
 
 		 779 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  36.93 
 
 		 780 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  33.86 
 
 		 766 aa  257  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  38.65 
 
 		 782 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  39.22 
 
 		 782 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  33.55 
 
 		 980 aa  247  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  30.39 
 
 		 774 aa  238  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  33.43 
 
 		 855 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 908 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  36.4 
 
 		 731 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  35.78 
 
 		 680 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  36.25 
 
 		 706 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  35.86 
 
 		 679 aa  230  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 		 927 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  34.04 
 
 		 706 aa  229  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0258  penicillin-binding protein 1C  36.38 
 
 		 699 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  32.5 
 
 		 704 aa  228  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  32.64 
 
 		 816 aa  226  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  30.99 
 
 		 787 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  30.99 
 
 		 787 aa  226  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 861 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  30.99 
 
 		 787 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  37.02 
 
 		 696 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  34.6 
 
 		 807 aa  224  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1078  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.18 
 
 		 724 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00006738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  31.79 
 
 		 794 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 662 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  30.96 
 
 		 667 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  32.47 
 
 		 797 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5148  penicillin-binding protein 1C  32.7 
 
 		 809 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5133  penicillin-binding protein 1C  32.86 
 
 		 809 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  34.8 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  30.69 
 
 		 772 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0509  penicillin-binding protein 1C  32.85 
 
 		 804 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  34.8 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  36.21 
 
 		 745 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3235  penicillin-binding protein 1C  32.86 
 
 		 809 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  31.35 
 
 		 762 aa  219  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  34.97 
 
 		 771 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  31.04 
 
 		 693 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  34.8 
 
 		 771 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  29.92 
 
 		 722 aa  217  7e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  36.18 
 
 		 793 aa  216  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  35.47 
 
 		 750 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 701 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  34.68 
 
 		 771 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 		 744 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1293  penicillin-binding protein 1C  34.49 
 
 		 772 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  32.02 
 
 		 762 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  32.19 
 
 		 760 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.9 
 
 		 774 aa  215  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  34.8 
 
 		 684 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  30.89 
 
 		 734 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0023  penicillin-binding protein 1C  35.19 
 
 		 674 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  26.4 
 
 		 716 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  32.02 
 
 		 760 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  37.04 
 
 		 794 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  35.07 
 
 		 774 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2772  penicillin-binding protein 1C  36.49 
 
 		 690 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  33.45 
 
 		 760 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  30.63 
 
 		 775 aa  212  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  35.4 
 
 		 696 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7154  penicillin-binding protein 1C  34.73 
 
 		 692 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334526  normal  0.789669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  35.93 
 
 		 780 aa  211  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1355  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 674 aa  211  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>