More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2652 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  55.37 
 
 		 745 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  57.64 
 
 		 746 aa  789    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  55.9 
 
 		 745 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  54.38 
 
 		 747 aa  744    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  66.88 
 
 		 742 aa  951    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  56.05 
 
 		 844 aa  754    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 768 aa  1517    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  57.99 
 
 		 726 aa  782    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  96.74 
 
 		 758 aa  1417    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  57.79 
 
 		 785 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  73.32 
 
 		 784 aa  1031    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  54.66 
 
 		 747 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  69.95 
 
 		 774 aa  981    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  54.66 
 
 		 747 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  55.84 
 
 		 745 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  69.2 
 
 		 747 aa  955    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  54.66 
 
 		 747 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  48.37 
 
 		 713 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  47.41 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  61.67 
 
 		 942 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  61.67 
 
 		 951 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  61.67 
 
 		 923 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  61.67 
 
 		 913 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  61.67 
 
 		 1060 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  44.73 
 
 		 729 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  33.47 
 
 		 719 aa  346  7e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  32.44 
 
 		 762 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  34.07 
 
 		 798 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 		 759 aa  296  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  37.89 
 
 		 853 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  31.48 
 
 		 857 aa  278  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  32.53 
 
 		 770 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  37.03 
 
 		 860 aa  270  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 		 952 aa  267  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  35.07 
 
 		 801 aa  262  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.93 
 
 		 779 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  33.66 
 
 		 780 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  36.85 
 
 		 782 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  33.06 
 
 		 980 aa  243  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  33.64 
 
 		 855 aa  240  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  34.74 
 
 		 861 aa  240  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  28.81 
 
 		 734 aa  235  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  32.38 
 
 		 793 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  38.63 
 
 		 782 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  29.69 
 
 		 774 aa  232  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  26.41 
 
 		 716 aa  231  3e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 		 927 aa  230  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  32.3 
 
 		 766 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  30.62 
 
 		 816 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 908 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 		 774 aa  224  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 1037 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  33.92 
 
 		 797 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  35.16 
 
 		 696 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  32.57 
 
 		 807 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  31.9 
 
 		 762 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  31.77 
 
 		 760 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  31.05 
 
 		 787 aa  210  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  31.05 
 
 		 787 aa  210  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  31.05 
 
 		 787 aa  210  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  26.95 
 
 		 722 aa  207  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  31.94 
 
 		 760 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  31.94 
 
 		 762 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  33.73 
 
 		 679 aa  207  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  33.93 
 
 		 780 aa  207  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1078  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.81 
 
 		 724 aa  207  8e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00006738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  31.94 
 
 		 760 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2143  penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 765 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  33.14 
 
 		 774 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  34.09 
 
 		 680 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.83 
 
 		 761 aa  205  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  34.18 
 
 		 794 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  33.95 
 
 		 706 aa  204  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  34.18 
 
 		 794 aa  204  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  35.01 
 
 		 782 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  28.12 
 
 		 794 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  35.26 
 
 		 696 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  32.17 
 
 		 774 aa  201  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.96 
 
 		 770 aa  200  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.81 
 
 		 833 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  30.15 
 
 		 667 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  33.66 
 
 		 728 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3968  penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1530  penicillin-binding protein 1C  30.38 
 
 		 764 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  31.31 
 
 		 770 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  32.39 
 
 		 691 aa  198  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  31.31 
 
 		 770 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  31.31 
 
 		 770 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  38.42 
 
 		 799 aa  197  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  31.31 
 
 		 770 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  31.47 
 
 		 770 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  32.6 
 
 		 750 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  31.47 
 
 		 770 aa  197  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 720 aa  197  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  32.74 
 
 		 712 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  33.44 
 
 		 782 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  31.15 
 
 		 770 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  32.77 
 
 		 727 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  32.69 
 
 		 727 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7154  penicillin-binding protein 1C  33.22 
 
 		 692 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334526  normal  0.789669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>