More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3142 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  55.4 
 
 		 745 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  54.52 
 
 		 745 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  57.43 
 
 		 746 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  69.24 
 
 		 758 aa  932    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  70.27 
 
 		 747 aa  1001    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  68.3 
 
 		 768 aa  926    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  53.88 
 
 		 747 aa  727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  54.65 
 
 		 747 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  56.37 
 
 		 844 aa  756    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  56.28 
 
 		 785 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  64.34 
 
 		 774 aa  893    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  58.57 
 
 		 726 aa  787    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  54.65 
 
 		 747 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 742 aa  1489    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  65.71 
 
 		 784 aa  925    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  54.35 
 
 		 745 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  54.65 
 
 		 747 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  48.28 
 
 		 713 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  63.12 
 
 		 1060 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  63.12 
 
 		 923 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  63.12 
 
 		 942 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  63.12 
 
 		 951 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  63.12 
 
 		 913 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  45.62 
 
 		 729 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  46.66 
 
 		 705 aa  512  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  35.24 
 
 		 719 aa  352  1e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  33.38 
 
 		 762 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  36.9 
 
 		 798 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 759 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  30.59 
 
 		 770 aa  280  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  33.29 
 
 		 853 aa  279  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 		 860 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  39.54 
 
 		 779 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  31.65 
 
 		 857 aa  265  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  35.65 
 
 		 801 aa  262  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  34.14 
 
 		 952 aa  260  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  38.42 
 
 		 782 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  38.66 
 
 		 782 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  30.31 
 
 		 780 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  32.59 
 
 		 816 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  32.32 
 
 		 734 aa  241  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  35.47 
 
 		 793 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  28.33 
 
 		 716 aa  239  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  32.97 
 
 		 855 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  30.32 
 
 		 774 aa  232  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 861 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  37.84 
 
 		 807 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  30.57 
 
 		 980 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.06 
 
 		 774 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  34.62 
 
 		 780 aa  225  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  31.6 
 
 		 766 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  32.63 
 
 		 760 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 927 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  30.68 
 
 		 679 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  33.21 
 
 		 760 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  33.21 
 
 		 762 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  34.7 
 
 		 706 aa  220  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  34.82 
 
 		 696 aa  220  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 908 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  33.03 
 
 		 760 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  36.06 
 
 		 774 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  34.76 
 
 		 680 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  28.65 
 
 		 722 aa  213  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1293  penicillin-binding protein 1C  29.25 
 
 		 772 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7154  penicillin-binding protein 1C  31.73 
 
 		 692 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334526  normal  0.789669 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1078  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.11 
 
 		 724 aa  211  5e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00006738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  31.37 
 
 		 762 aa  211  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  31.62 
 
 		 684 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  35.19 
 
 		 771 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  35.19 
 
 		 771 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  35.19 
 
 		 771 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  35.28 
 
 		 782 aa  207  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  34.75 
 
 		 696 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  32.34 
 
 		 750 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  35.34 
 
 		 771 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  34.14 
 
 		 706 aa  207  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  34.42 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  34.24 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  34.42 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  34.42 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  34.42 
 
 		 770 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  34.42 
 
 		 770 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  31.95 
 
 		 782 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  30.31 
 
 		 691 aa  206  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  34.42 
 
 		 770 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  34.23 
 
 		 770 aa  205  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  34.95 
 
 		 774 aa  205  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 770 aa  204  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  34.24 
 
 		 770 aa  204  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  35.02 
 
 		 771 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0023  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 		 674 aa  203  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6006  penicillin-binding protein 1C  31.14 
 
 		 693 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.46 
 
 		 720 aa  203  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  32.69 
 
 		 731 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  34.6 
 
 		 794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  34.77 
 
 		 794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  32.17 
 
 		 728 aa  200  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  32.18 
 
 		 727 aa  200  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  33.06 
 
 		 745 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.95 
 
 		 727 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>