More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1126 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  73.03 
 
 		 747 aa  1084    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  94.89 
 
 		 942 aa  1591    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  73.02 
 
 		 745 aa  1048    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  98.53 
 
 		 951 aa  1475    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  77.22 
 
 		 747 aa  1199    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  63.99 
 
 		 785 aa  916    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  73.5 
 
 		 745 aa  1096    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  96.66 
 
 		 923 aa  1537    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  83.61 
 
 		 844 aa  1366    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  94.32 
 
 		 1060 aa  1325    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  73.03 
 
 		 747 aa  1084    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  77.19 
 
 		 745 aa  1170    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  73.03 
 
 		 747 aa  1084    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 913 aa  1783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  60.46 
 
 		 746 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  62.16 
 
 		 726 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  61.87 
 
 		 742 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  60.55 
 
 		 747 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  59.52 
 
 		 784 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  63.34 
 
 		 758 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  61.78 
 
 		 768 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  61.38 
 
 		 774 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  50 
 
 		 705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  49.22 
 
 		 713 aa  355  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  47.89 
 
 		 729 aa  340  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  36.02 
 
 		 860 aa  270  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  31.99 
 
 		 952 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  36.01 
 
 		 853 aa  266  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.89 
 
 		 779 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  35.8 
 
 		 782 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  36.13 
 
 		 782 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  30.74 
 
 		 770 aa  226  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  32.18 
 
 		 861 aa  225  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  28.59 
 
 		 1037 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  33.55 
 
 		 719 aa  219  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  30.91 
 
 		 816 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  30.29 
 
 		 980 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 		 855 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  33.17 
 
 		 857 aa  215  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 		 759 aa  215  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  29.68 
 
 		 801 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  36.03 
 
 		 798 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  32.86 
 
 		 762 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  28.41 
 
 		 648 aa  202  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  31.96 
 
 		 745 aa  201  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  36.11 
 
 		 793 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  32.58 
 
 		 770 aa  199  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  37.28 
 
 		 780 aa  197  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  35.76 
 
 		 679 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  33.28 
 
 		 771 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  31.21 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 		 927 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  29.31 
 
 		 780 aa  188  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  34.83 
 
 		 727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.83 
 
 		 727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  29.77 
 
 		 662 aa  185  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  32.05 
 
 		 784 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  35.1 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 		 770 aa  185  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  31.19 
 
 		 774 aa  185  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  36.73 
 
 		 770 aa  184  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  36.2 
 
 		 782 aa  184  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 		 770 aa  184  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 		 770 aa  184  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  36.73 
 
 		 770 aa  184  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  36.73 
 
 		 770 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  36.73 
 
 		 770 aa  184  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  36.65 
 
 		 750 aa  184  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  36.73 
 
 		 770 aa  184  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.84 
 
 		 765 aa  183  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  36.88 
 
 		 680 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  36.79 
 
 		 706 aa  183  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 667 aa  183  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0309  penicillin-binding protein 1C  26.39 
 
 		 792 aa  182  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.89 
 
 		 728 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.83 
 
 		 761 aa  182  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  36.26 
 
 		 782 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 908 aa  182  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  35.75 
 
 		 731 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  36.63 
 
 		 807 aa  181  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  30.61 
 
 		 712 aa  181  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  31.8 
 
 		 766 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  38.06 
 
 		 771 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  38.06 
 
 		 771 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  29.39 
 
 		 723 aa  180  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  38.06 
 
 		 771 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  32.38 
 
 		 784 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  36.97 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  30.27 
 
 		 774 aa  178  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  32.78 
 
 		 744 aa  178  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  32.22 
 
 		 784 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  28.32 
 
 		 788 aa  177  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  32.45 
 
 		 701 aa  177  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  29.07 
 
 		 693 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  29.76 
 
 		 704 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 831 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  24.66 
 
 		 716 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  30.43 
 
 		 784 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 654 aa  175  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 779 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>