More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3529 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  77.27 
 
 		 746 aa  1122    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  58.56 
 
 		 745 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  58.69 
 
 		 747 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  59.57 
 
 		 758 aa  777    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  56.66 
 
 		 774 aa  748    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  58.11 
 
 		 745 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  56.76 
 
 		 844 aa  780    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  58.52 
 
 		 747 aa  797    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  57.61 
 
 		 784 aa  773    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  58.5 
 
 		 768 aa  770    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  58.57 
 
 		 742 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 726 aa  1461    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  57.75 
 
 		 747 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  59.65 
 
 		 785 aa  777    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  58.62 
 
 		 745 aa  792    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  57.75 
 
 		 747 aa  778    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  57.75 
 
 		 747 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  49.1 
 
 		 713 aa  609  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  48.85 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  62.88 
 
 		 923 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  62.88 
 
 		 942 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  62.88 
 
 		 951 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  45.67 
 
 		 729 aa  539  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  62.88 
 
 		 913 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  62.88 
 
 		 1060 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  33.88 
 
 		 719 aa  340  5e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  31.95 
 
 		 762 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 759 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  36.52 
 
 		 853 aa  283  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 860 aa  277  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  32.77 
 
 		 857 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  36.33 
 
 		 798 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  33.48 
 
 		 952 aa  262  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  39.26 
 
 		 779 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  39.89 
 
 		 782 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  32.46 
 
 		 770 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  39.03 
 
 		 782 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  36 
 
 		 680 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  36.38 
 
 		 750 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  35.84 
 
 		 706 aa  240  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  33.56 
 
 		 793 aa  236  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  35.86 
 
 		 731 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 774 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  36.38 
 
 		 745 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  34.69 
 
 		 706 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  30.15 
 
 		 734 aa  226  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 801 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  37.24 
 
 		 696 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  31.57 
 
 		 766 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  30.85 
 
 		 679 aa  221  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 861 aa  220  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  29.07 
 
 		 774 aa  220  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 855 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  35.37 
 
 		 696 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  31.64 
 
 		 780 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0258  penicillin-binding protein 1C  36.35 
 
 		 699 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  31.23 
 
 		 816 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  33.99 
 
 		 780 aa  214  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  30.86 
 
 		 980 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 		 927 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 908 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  27.08 
 
 		 722 aa  211  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  30.9 
 
 		 797 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  30.63 
 
 		 774 aa  211  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  31.7 
 
 		 782 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  32.33 
 
 		 774 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  33.27 
 
 		 774 aa  207  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  32.49 
 
 		 770 aa  207  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  32.49 
 
 		 770 aa  207  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  32.49 
 
 		 770 aa  207  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  28.6 
 
 		 716 aa  207  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0509  penicillin-binding protein 1C  30.21 
 
 		 804 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583992  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  32.49 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  33.66 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  32.49 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  33.66 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  33.85 
 
 		 771 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  32.19 
 
 		 770 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  33.1 
 
 		 807 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  32.49 
 
 		 770 aa  205  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  33.59 
 
 		 771 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  33.66 
 
 		 771 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.41 
 
 		 770 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  32.44 
 
 		 770 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  31.63 
 
 		 782 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  32.31 
 
 		 770 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  30.92 
 
 		 760 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  28.84 
 
 		 787 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  28.84 
 
 		 787 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  28.84 
 
 		 787 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  31.65 
 
 		 794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 662 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30 
 
 		 765 aa  201  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  32.99 
 
 		 712 aa  201  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 763 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3446  penicillin-binding protein 1C  31.31 
 
 		 695 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  31.03 
 
 		 762 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  32.72 
 
 		 695 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6006  penicillin-binding protein 1C  30.41 
 
 		 693 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>