More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0941 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  54.67 
 
 		 784 aa  732    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  60.78 
 
 		 942 aa  874    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  58.05 
 
 		 923 aa  810    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  56.96 
 
 		 746 aa  799    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  56.68 
 
 		 747 aa  748    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  60.13 
 
 		 951 aa  851    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  70.49 
 
 		 747 aa  1020    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  67.06 
 
 		 844 aa  979    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  71.01 
 
 		 745 aa  1016    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  71.22 
 
 		 747 aa  1018    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  60.05 
 
 		 726 aa  806    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  63.59 
 
 		 913 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  71.22 
 
 		 747 aa  1018    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  57.89 
 
 		 774 aa  743    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  56.41 
 
 		 742 aa  761    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  57.79 
 
 		 768 aa  733    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 785 aa  1566    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  58.89 
 
 		 758 aa  742    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  65.76 
 
 		 1060 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  71.54 
 
 		 745 aa  1017    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  71.22 
 
 		 747 aa  1018    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  71.1 
 
 		 745 aa  998    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  47.59 
 
 		 713 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  46.59 
 
 		 705 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  44.94 
 
 		 729 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  33.82 
 
 		 719 aa  362  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  31.82 
 
 		 762 aa  313  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 		 759 aa  301  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  31.76 
 
 		 798 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  37.48 
 
 		 860 aa  289  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  34.56 
 
 		 952 aa  290  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  36.54 
 
 		 853 aa  283  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  29.91 
 
 		 770 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  34.83 
 
 		 779 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  35.1 
 
 		 782 aa  270  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  34.39 
 
 		 801 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  30.36 
 
 		 857 aa  269  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  34.83 
 
 		 782 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 927 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  33.39 
 
 		 980 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 		 774 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  36.76 
 
 		 793 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  35.12 
 
 		 780 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  36.51 
 
 		 680 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 908 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 861 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  32.33 
 
 		 855 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  30.01 
 
 		 780 aa  231  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  36.19 
 
 		 706 aa  231  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  31.76 
 
 		 774 aa  230  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  33.5 
 
 		 770 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  33.5 
 
 		 770 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  33.66 
 
 		 770 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  31.74 
 
 		 782 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 1037 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  33.5 
 
 		 770 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  33.5 
 
 		 770 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  34.93 
 
 		 679 aa  228  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  33.33 
 
 		 770 aa  228  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  36.2 
 
 		 807 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  32.54 
 
 		 766 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  33.5 
 
 		 770 aa  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  32.06 
 
 		 816 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  33.17 
 
 		 770 aa  225  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  33.33 
 
 		 770 aa  224  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  36.35 
 
 		 750 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  32.84 
 
 		 728 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  34.86 
 
 		 731 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  35.67 
 
 		 784 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  34.37 
 
 		 784 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  34.52 
 
 		 784 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  31.24 
 
 		 782 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  34.59 
 
 		 706 aa  220  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  28.92 
 
 		 734 aa  219  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  33.67 
 
 		 712 aa  219  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33 
 
 		 727 aa  219  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.87 
 
 		 734 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33 
 
 		 727 aa  219  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  32.29 
 
 		 662 aa  218  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  27.46 
 
 		 772 aa  217  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  32.46 
 
 		 774 aa  217  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  35.21 
 
 		 771 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  27.32 
 
 		 775 aa  217  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  35.79 
 
 		 696 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  34.82 
 
 		 771 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  33.7 
 
 		 784 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0023  penicillin-binding protein 1C  31.64 
 
 		 674 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  35.08 
 
 		 774 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  35.21 
 
 		 771 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  35.21 
 
 		 771 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  34.7 
 
 		 745 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  31.13 
 
 		 760 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  35.21 
 
 		 771 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.4 
 
 		 714 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  32.33 
 
 		 704 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.1 
 
 		 741 aa  214  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.94 
 
 		 714 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  30.17 
 
 		 762 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  32.09 
 
 		 667 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  35.17 
 
 		 696 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>