81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1423 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0939  hypothetical protein  44.58 
 
 		 1023 aa  845    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727503  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2715  glycosyl transferase family protein  46.87 
 
 		 1035 aa  877    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54080  hypothetical protein  47.13 
 
 		 1041 aa  910    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2662  glycosyl transferase family protein  47.73 
 
 		 1035 aa  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1411  hypothetical protein  45.19 
 
 		 1023 aa  850    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0630  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  48.86 
 
 		 1014 aa  894    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2841  hypothetical protein  45.15 
 
 		 1025 aa  846    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0766  transglycosylase  48.5 
 
 		 1039 aa  878    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.707274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0778  transglycosylase  48.81 
 
 		 1039 aa  883    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1359  glycosyl transferase family 51  98.91 
 
 		 1011 aa  2051    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.55048  normal  0.0318289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2505  hypothetical protein  45.21 
 
 		 1023 aa  838    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4577  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1026 aa  903    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1253  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  48.32 
 
 		 1032 aa  908    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.722125  normal  0.576763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0605  hypothetical protein  44.41 
 
 		 1015 aa  838    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3596  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 		 1019 aa  898    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2587  glycosyl transferase family protein  46.57 
 
 		 1035 aa  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1099  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  49.14 
 
 		 1049 aa  915    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0789569  normal  0.292467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4731  hypothetical protein  47.63 
 
 		 1031 aa  922    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.537411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2860  hypothetical protein  45.36 
 
 		 1025 aa  848    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3465  hypothetical protein  51.56 
 
 		 1024 aa  936    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.038235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2691  glycosyl transferase family protein  47.73 
 
 		 1035 aa  871    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2989  hypothetical protein  45.26 
 
 		 1025 aa  846    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.907067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0636  glycosyl transferase family protein  46.74 
 
 		 1035 aa  862    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1088  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  49.34 
 
 		 1045 aa  922    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4354  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  49.54 
 
 		 1049 aa  926    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0974  glycosyl transferase family protein  48.92 
 
 		 1034 aa  951    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1058  hypothetical protein  49.14 
 
 		 1049 aa  916    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1476  hypothetical protein  74.14 
 
 		 1035 aa  1534    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.370096  normal  0.0732743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4191  hypothetical protein  48.45 
 
 		 1045 aa  909    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3925  hypothetical protein  48.68 
 
 		 1045 aa  920    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511615  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1423  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 1011 aa  2064    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.943625  normal  0.639754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2920  hypothetical protein  45.75 
 
 		 1008 aa  846    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.588499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3809  glycosyl transferase family 51  48.95 
 
 		 1001 aa  914    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662369  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5232  transmembrane protein  50.99 
 
 		 1066 aa  972    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2462  transmembrane protein  48.72 
 
 		 1095 aa  890    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0942  hypothetical protein  48.7 
 
 		 1038 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4564  hypothetical protein  47.6 
 
 		 1029 aa  929    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5990  glycosyl transferase family protein  47.27 
 
 		 1035 aa  865    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0627  hypothetical protein  47.77 
 
 		 1030 aa  888    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13960  Glycosyl transferase, family 51  47.21 
 
 		 1029 aa  875    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2992  glycosyl transferase family protein  53.69 
 
 		 1014 aa  1022    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0185  glycosyl transferase family protein  53.52 
 
 		 1014 aa  1001    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.924326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0890  hypothetical protein  49.18 
 
 		 1026 aa  906    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3098  hypothetical protein  45.19 
 
 		 1010 aa  839    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5928  putative membrane carboxypeptidase (Penicillin-binding) transmembrane protein  50.69 
 
 		 1022 aa  944    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1517  hypothetical protein  45.15 
 
 		 1025 aa  845    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2051  glycosyl transferase family protein  47.73 
 
 		 1035 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1358  hypothetical protein  45.39 
 
 		 1023 aa  855    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.831735  normal  0.146339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1423  hypothetical protein  45.13 
 
 		 1022 aa  857    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.925516  normal  0.412247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.11 
 
 		 950 aa  55.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  28.57 
 
 		 890 aa  55.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  24.01 
 
 		 705 aa  53.5  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  27.34 
 
 		 784 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  29.47 
 
 		 774 aa  50.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  27.23 
 
 		 824 aa  50.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  22.95 
 
 		 665 aa  49.7  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  28.53 
 
 		 771 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  24.86 
 
 		 836 aa  48.5  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  28.53 
 
 		 771 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  28.95 
 
 		 782 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  28.23 
 
 		 771 aa  48.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  31.87 
 
 		 794 aa  48.1  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  31.87 
 
 		 794 aa  48.1  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  25.82 
 
 		 794 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  27.7 
 
 		 803 aa  47.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  25.41 
 
 		 814 aa  47.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  28.23 
 
 		 771 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  27.44 
 
 		 793 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  29.61 
 
 		 771 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  26.83 
 
 		 852 aa  46.2  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  28.68 
 
 		 784 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  29.51 
 
 		 774 aa  46.2  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  27.84 
 
 		 774 aa  45.8  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  31.58 
 
 		 748 aa  45.8  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  29.05 
 
 		 770 aa  45.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  26.74 
 
 		 784 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  27.81 
 
 		 751 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  28.14 
 
 		 679 aa  45.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  25 
 
 		 698 aa  45.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  28.29 
 
 		 784 aa  44.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  28.98 
 
 		 691 aa  44.7  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>